Neues Verfahren von Covaris ermöglicht präzise, für NGS-Niveau geeignete RNA-Extraktion aus FFPE-Gewebeproben
(ots) - Covaris, Inc. hat das
truXTRAC FFPE RNA-Kit eingeführt. Diese neueste Innovation von
Covaris extrahiert hochqualitative RNA, die sich für Next Gen
Sequencing (NGS) eignet, aus FFPE-Gewebeproben. NGS-Qualität wird
durch die Verwendung der patentierten Adaptive Focused Acoustics(®)
(AFA)-Technologie von Covaris erreicht, die mit einem optimierten
Reagenziensystem kombiniert wird. Die truXTRAC FFPE
RNA-Extraktionsmethode setzt genau gesteuerte, fokussierte
Schallenergie ein, um Paraffin aus Fixed-Formalin, Paraffin-Embedded
(FFPE)-Proben [formalinfixierte, in Paraffin eingebettete Proben] zu
entfernen, ohne organische Lösungsmittel zu benutzen. Dadurch wird
eine effiziente und schnelle Gewebe-Rehydration, Gewebeverdau,
Crosslink-Umkehrung und Nukleinsäure-Freisetzung ermöglicht.
Als Resultat dieser fortschrittlichen Methodik liefert das
truXTRAC FFPE RNA-Kit eine erhöhte Ausbeute an hochqualitativer RNA,
die für komplexe molekularbiologische Assays jederzeit verfügbar ist.
Beispielsweise ist die verbesserte Amplifizierbarkeit eine zentrale
Eigenschaft für den effizienten Aufbau von NGS-Bibliotheken und die
truXTRAC FFPE RNA-Methode ergibt Sequenzierungsmetriken von höherer
Qualität und ermöglicht neue klinische Anwendungen.
Jim Laugharn, CEO von Covaris, erläuterte: "Transkriptom-Analyse
wird zu einem Routineinstrument zur Bewertung des Fortschreitens
einer Erkrankung. Klinische Labore sind in zunehmendem Maße auf
FFPE-extrahierte RNA angewiesen, allerdings macht die geringe
Qualität der RNA, die aus traditionellen Extraktionsmethoden gewonnen
wird, sie ungeeignet für die klinische Verwendung. Das
Covaris-Verfahren für eine präzise RNA-Extraktion ist einzigartig
aufgestellt, um die Sensitivität und die analytischen Anforderungen
der klinischen Anwendungen zu erfüllen, insbesondere für
Next-Generation-Sequenzierung."
Klinische Gewebeproben werden oft in FFPE-Blöcken stabilisiert, um
die Histologie beizubehalten, wobei die biochemische Analyse ein
zweitrangiges Anliegen ist. Die extreme Formaldehyd-Fixierung und die
aggressive Gewebe-Austrocknung von FFPE-konservierten Gewebeschnitten
war früher eine technische Schwierigkeit im Hinblick auf die präzise,
korrekte RNA-Extraktion für die Nutzung in RNA-Seq mit NGS. Außerdem
hatte der Prozess lange Verfahrenszeiten und komplizierte
Arbeitsabläufe unter klinischen Laborbedingungen zur Folge. Das
truXTRAC FFPE RNA-Kit von Covaris bringt die Technologie der
Probenpräparation voran und bietet eine zuverlässige, reproduzierbare
und schnelle Methodik, die die klinischen Labors benötigen.
Web site: http://www.covarisinc.com/
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Datum: 16.12.2014 - 15:03 Uhr
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